Tirocini 2021/2022

AziendaProgetto
GSK Vaccines, SienaAnalisi automatizzata di array di proteine per mappare le interazioni antigene-anticorpo
laboratorio di ricerca SAILAB, c/o DIISM, UNISIReti neurali per grafi per la previsione delle proprietà molecolari della replicazione del virus HIV
Dipartimento di Biotecnologie Mediche, UNISIDGenome analysis of new pandemic clone ST1193 Escherichia coli from healthy children of the Bolivian Chaco
IIGM CandioloAnalisi del profilo genomico di sarcoma di Ewing in pazienti pediatrici
IIT CNR PisaMulti-homic data integration for the study of colon-rectal cancer heterogeneity
Siena ImagingSviluppo di una pipeline di analisi di immagini cerebrali di RM per normalizzare le intensità e migliorare la quantificazione dei volumi cerebrali normativi
Polo GGB, SienaAnalysis of whole genome sequencing data to study the genome of a transgenic mosquito strain
Liquidweb, SienaVisual imagery: classificazione basata su regole
IIT CNR, PisaMachine learning per l'analisi di dati Single-cell di pazienti affetti da COVID-19
CNR BariSelection of aging-correlated molecular biomarkers through the analysis of transcriptomes extracted from brain tissues
Fisiologia Clinica del CNR di Pisa, all'interno del laboratorio di proteomica e lipidomicaDysregulation of RNA expression profile and association with genomic CNV in coronary artery disease
GSK Vaccines, SienaGenomic differentiation of Neisseria Gonorrhoeae strains in relation to antimicrobial resistance
Dip. Sci. Farmacologiche e Biomolecolari, Univ. MilanoFunctional proteomic characterization of exomeres secreted by a lymph nodal metastatic cell line: a ticking bomb.
Universita' di UdineSviluppo di una pipeline bioinformatica per l'individuazione di antibiotico-resistenze nel suolo
UOC Genetica Medica di Fondazione IRCCS-Casa Sollievo della Sofferenza (San Giovanni Rotondo, FG)Specifications and validation of the ACMG/AMP criteria for clinical interpretation of sequence variants in hereditary connective tissue disorders associated to COL1A1, COL1A2, COL2A1, COL3A1, COL5A1, COL5A2, COL11A1, COL11A2 and COL12A1
ASL BariAnalisi dell'espressione differenziale in dati di RNA-sequencing nel carcinoma polmonare a cellule squamose
Istituto Zooprofilattico Sperimentale Umbria e MarcheWhole genome sequencing of Pasteurella multocida isolates from diseased rabbits in Italy
Lab. Bioinformatica-Ospedale PratoUtilizzo di pipeline computazionali per il processamento di dati RNA-seq: applicazione per l'analisi del trascrittoma di linee cellulari di tumore mammario e resistenza a inibitori CDK4/6
Center for Immuno-Oncology, AOU SienaRStudio nell’analisi statistica sul metaboloma di pazienti affetti da melanoma metastatico
IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori, Milano Gene expression signatures for head and neck cancer patient stratification: a structured database with a biological functional workflow.
Polo GGB, SienaPool seq and machine learning applied to a discovery and prevalence study of SARS-Cov2 variants
GSK Vaccines, SienaMolecular characterization of the “dock, lock and latch” and catch-bond mechanisms of Staphylocuccus aureus adhesin ClfB by molecular simulations
Laboratorio SAIlab UNISIModellare sistemi biologici attraverso i Reaction Systems
GSK Vaccines, SienaCaratterizzazione genetica dei ceppi batterici responsabili di infezioni gravi in soggetti in età pediatrica
Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica Analisi multivariata dei dati di micro-spettroscopia Raman su gameti maschili

Tirocini 2022/2023

AziendaProgetto
GSK Vaccines, SienaAutomated pipeline for Phase Variation subpopulation extraction
laboratorio di ricerca SAILAB, c/o DIISM, UNISICNN per il riconoscimento automatico di infezione da malaria in campioni di sangue
Fondazione Edmund Mach di San Michele all'Adige (TN), Unità BiologiaAfta epizootica: pipeline per l'identificazione di ricombinazione virale
Achilles Vaccines, SienaL'Intelligenza Artificiale come strumento per sostituire e ridurre l'uso di animali nella sperimentazione di farmaci
IMT LuccaAnalisi dell'evoluzione dei geni imprinted attraverso l'ultimo massimo glaciale
Dip. Biologia UNIFIMeDuSa2 WebApp – controlli sugli input e revisione del codice
TLS, SienaDiscovery of the suppressor signatures involved in the indolence and spontaneous regression of chronic lymphocytic leukemia
BIORSAF, GrossetoIl Machine Learning per la valutazione del rischio nell'industria alimentare
CNR SegrateStudio di associazione genome-wide per indagare le basi genetiche dell'efficacia del vaccino anti-SARS-CoV-2
Polo GGB, SienaRicerca di sistemi CRISPR-Cas9 endogeni nel microbioma di zanzare Anopheles e Aedes
IMT LuccaSviluppo di un modello di machine learning predittivo della gravità del crimine commesso in un campione di criminali adulti: focus sulle caratteristiche genetiche e di morfologia cerebrale
Polo GGB, SienaDeep learning tracking and pose estimation of Anopheles mosquitoes during hematophagic activity
Dip. Scienze della terra, UNISIAnalisi trascrittomica in una specie non modello: M. Galloprovincialis
Biochemie Lab, FirenzeAutomazione del processo di caratterizzazione, classificazione e stima del LEG su campioni di sedimento marino
Scuola Bioscienze, UNICAMAnalisi pangenomica dei ceppi di Paenibacillus Polymyxa svela l'esistenza di due specie funzionalmente distinte
Laboratorio di statistica clinica ed epidemiologia, UNIMIAndamenti globali di incidenza e mortalità per il tumore anale
IRCCS Istituto Centro San Giovanni di Dio Fatebenefratelli, BresciaAnalisi predittiva di demenza e parametri ad essa associati
Fondazione Edmund Mach di San Michele all'Adige, Unita' BiologiaGen2Met: un pacchetto R in era “multi-omica”
Dip. Biologia UNIFISimulazione degli effetti metabolici di composti contenenti sali d’oro sulle cellule di tumore ovarico
Dipartimento di Scienze e Alta Tecnologia dell'Università degli Studi dell'InsubriaA network model of Autism Spectrum Disorder: topological analysis for prioritization of WES data
Dip. Biologia UNIFIAnalisi delle dinamiche della comunità microbica nella Fibrosi Cistica tramite il modello di Lotka-Volterra
Polo GGB, SienaSviluppo della pipeline bioinformatica di genotype imputation per l’analisi dei dati di shallow-WGS
Dip. Biologia Ambientale, La SapienzaValidation of a bioinformatic tool for the identification of microorganisms through amplicon sequencing